別看竇材艾灸用的那麼好，其實艾灸還是有一定的禁忌的，只是大病必須使用艾灸，一般的疾病不一定必須使用艾灸，即使要使用艾灸，還是需要辨別虛實寒熱。
竇材書中所記載的疾病的治療，大多數都是虛寒性疾病，雖然期間有一兩個熱性疾病，也是真寒假熱。
張仲景說“火氣雖微，內攻有力，焦骨傷筋，血難復也”，艾灸適用於虛寒性疾病，但是不一定適用於陰虛，或者陽郁患者，對於脾胃虛弱的患者，如果艾灸之，因為氣血生化之源不強，艾灸刺激太過，也會導致不適。
古代艾灸除了辨陰陽之外，還有很多禁忌，比如有所謂的人神在日不宜灸，所謂的人神在，就是人體之氣血之特殊時刻，一月之中，各有分佈：初一（在足大指）、初二（在外踝）、初三（在股內）、初四（在腰）、初五（在口）、初六（在手）、初七（在內踝）、初八（在腕）、初九（在尻）、初十（在腰背）、十一（在鼻樑）、十二（在髮際）、十三（在牙齒）、十四（在胃脘）、十五（在遍身）、十六（在胸）、十七（在氣沖）、十八（在股內）、十九（在足）、二十（在內踝）、二十一（在手小指）、二十二（在外踝）、二十三（在肝及足）、二十四（在手陽明）、二十五（在足陽明）、二十六（在胸）、二十七（在膝）、二十八（在陰）、二十九（在膝脛）、三十（在足趺）；這些都是根據月亮對人體的影響而來，所以需要對照的是太陰曆。
時辰禁忌
除了以個月以內，每天都有一個特點的部位不宜灸，每天的十二個時辰，也是有禁忌的，“子踝丑腰寅在目，卯面辰頭巳三屬，午胸未腹申在心，酉背戌頭亥股續”，一般來說，我們艾灸都是在白天，所以大家需要禁忌的內容還很多，而未時主要是腹部，此時艾灸關元、氣海穴就不方便了，所以艾灸之時還是需要避免犯忌諱。
十二地支日禁忌
除了時辰，還有日子，也需要禁忌，比如甲子日，因為是子日地支，所以不能艾灸頭，而丑日則不能艾灸腰部。
“子不治頭君須認，丑日腰耳寅胸應。卯日鼻脾辰膝腰，巳手午心真快捷方式。未頭手足申頭背，酉行膝背同其類。戌日在陰頭面間，亥日遊行頭頸位。十二支神禁灸歌，男除女破應該會。”
十天干日禁忌
除了地支，還有天干，比如甲日不治頭部疾病，不針灸頭部，乙日不針灸耳朵和咽喉，等等。
“甲不治頭乙耳喉，丙肩丁背與心求。戊己腹脾庚腰肺，辛膝壬當腎脛收。癸日不宜針手足，十幹不犯則無憂。”
這些天干地支的分佈，其實跟人體的結構還是關係密切的，所以在艾灸的時候需要注意。歷來的醫書都不會說為什麼，但是當我們出了問題之後，反過來驗證，發現這些都比較準，我們焉得不注意？